Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Sec22bO08547 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sec22bO08547 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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