Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21310J3QQ23 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms