Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Gm8888J3QPX5 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Gm8888J3QPX5 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Gm8888J3QPX5 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Gm8888J3QPX5 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Gm8888J3QPX5 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Gm8888J3QPX5 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Gm8888J3QPX5 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Gm8888J3QPX5 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm8888J3QPX5 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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