Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP9

Fam240a, Family with sequence similarity 240 member A, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam240aJ3QNP9 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Fam240aJ3QNP9 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms