Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
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Top3bQ9Z321 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
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Top3bQ9Z321 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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Top3bQ9Z321 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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Top3bQ9Z321 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Top3bQ9Z321 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
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