Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PdcQ9QW08 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms