Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ap3m1Q9JKC8 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms