Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clstn2Q9ER65 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms