Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ45

Vmn1r46, Vomeronasal type-1 receptor 46, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r46Q9EQ45 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vmn1r46Q9EQ45 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms