Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Pop5Q9DB28 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms