Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Smco2Q9DA21 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms