Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
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Pdzd9Q9D9M4 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Pdzd9Q9D9M4 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
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Pdzd9Q9D9M4 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pdzd9Q9D9M4 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
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Pdzd9Q9D9M4 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Pdzd9Q9D9M4 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Pdzd9Q9D9M4 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Pdzd9Q9D9M4 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Pdzd9Q9D9M4 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Pdzd9Q9D9M4 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Pdzd9Q9D9M4 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Pdzd9Q9D9M4 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Pdzd9Q9D9M4 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Pdzd9Q9D9M4 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdzd9Q9D9M4 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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