Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Krt20Q9D312 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Krt20Q9D312 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms