Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed6Q9CQG0 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed6Q9CQG0 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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