Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
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UBE2E3Q969T4 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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UBE2E3Q969T4 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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UBE2E3Q969T4 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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UBE2E3Q969T4 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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UBE2E3Q969T4 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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UBE2E3Q969T4 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
UBE2E3Q969T4 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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