Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR2

Snx18, Sorting nexin-18, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18Q91ZR2 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Snx18Q91ZR2 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms