Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Ercc8Q8CFD5 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Ercc8Q8CFD5 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Ercc8Q8CFD5 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ercc8Q8CFD5 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
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