Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Liat1Q810M6 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Liat1Q810M6 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Liat1Q810M6 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Liat1Q810M6 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Liat1Q810M6 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Liat1Q810M6 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Liat1Q810M6 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Liat1Q810M6 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Liat1Q810M6 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Liat1Q810M6 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Liat1Q810M6 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Liat1Q810M6 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Liat1Q810M6 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Liat1Q810M6 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Liat1Q810M6 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Liat1Q810M6 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Liat1Q810M6 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Liat1Q810M6 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Liat1Q810M6 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Liat1Q810M6 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Liat1Q810M6 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Liat1Q810M6 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Liat1Q810M6 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Liat1Q810M6 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Liat1Q810M6 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Liat1Q810M6 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Liat1Q810M6 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Liat1Q810M6 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Liat1Q810M6 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Liat1Q810M6 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Liat1Q810M6 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Liat1Q810M6 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Liat1Q810M6 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Liat1Q810M6 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Liat1Q810M6 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Liat1Q810M6 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Liat1Q810M6 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Liat1Q810M6 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Liat1Q810M6 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Liat1Q810M6 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Liat1Q810M6 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Liat1Q810M6 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Liat1Q810M6 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Liat1Q810M6 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Liat1Q810M6 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Liat1Q810M6 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Liat1Q810M6 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Liat1Q810M6 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Liat1Q810M6 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Liat1Q810M6 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Liat1Q810M6 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Liat1Q810M6 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Liat1Q810M6 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Liat1Q810M6 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Liat1Q810M6 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Liat1Q810M6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Liat1Q810M6 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Liat1Q810M6 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Liat1Q810M6 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Liat1Q810M6 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Liat1Q810M6 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Liat1Q810M6 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Liat1Q810M6 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Liat1Q810M6 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Liat1Q810M6 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Liat1Q810M6 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Liat1Q810M6 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Liat1Q810M6 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Liat1Q810M6 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Liat1Q810M6 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Liat1Q810M6 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Liat1Q810M6 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms