Protein–RNA interactions for Protein: Q80VN0

Cfap100, Cilia- and flagella-associated protein 100, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap100Q80VN0 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cfap100Q80VN0 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms