Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nphp3Q7TNH6 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nphp3Q7TNH6 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms