Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
CltbQ6IRU5 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms