Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DbpQ60925 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DbpQ60925 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DbpQ60925 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DbpQ60925 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DbpQ60925 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DbpQ60925 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
DbpQ60925 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms