Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Prdm1Q60636 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms