Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Gm26226-201ENSMUST00000082509 116 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Gm12702-201ENSMUST00000123258 612 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Gm43452-201ENSMUST00000201873 991 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Pacs2Q3V3Q7 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms