Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Samd11Q1RNF8 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Samd11Q1RNF8 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Samd11Q1RNF8 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Samd11Q1RNF8 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms