Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Sh3bp2Q06649 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Sh3bp2Q06649 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Sh3bp2Q06649 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Sh3bp2Q06649 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Sh3bp2Q06649 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sh3bp2Q06649 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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