Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn6Q03958 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn6Q03958 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn6Q03958 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn6Q03958 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn6Q03958 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn6Q03958 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn6Q03958 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn6Q03958 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn6Q03958 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn6Q03958 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn6Q03958 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn6Q03958 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn6Q03958 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn6Q03958 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn6Q03958 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pfdn6Q03958 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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