Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Hoxd1Q01822 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Hoxd1Q01822 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms