Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp1P97350 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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