Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tp53bp1P70399 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
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Tp53bp1P70399 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Tp53bp1P70399 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Tp53bp1P70399 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tp53bp1P70399 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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