Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ppfia3P60469 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ppfia3P60469 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms