Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Apobec1P51908 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec1P51908 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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