Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ercc3P49135 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms