Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms