Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Hoxd10P28359 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Hoxd10P28359 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Hoxd10P28359 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Hoxd10P28359 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Hoxd10P28359 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Hoxd10P28359 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Hoxd10P28359 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Hoxd10P28359 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Hoxd10P28359 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hoxd10P28359 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Hoxd10P28359 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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