Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms