Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
P18530 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
P18530 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
P18530 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
P18530 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
P18530 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
P18530 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
P18530 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
P18530 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
P18530 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
P18530 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
P18530 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
P18530 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
P18530 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
P18530 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
P18530 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
P18530 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
P18530 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
P18530 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
P18530 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
P18530 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
P18530 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
P18530 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18530 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18530 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18530 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18530 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18530 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18530 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18530 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18530 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18530 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18530 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18530 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18530 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18530 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18530 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18530 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18530 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18530 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18530 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18530 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18530 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
P18530 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18530 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18530 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18530 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18530 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18530 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18530 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18530 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18530 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18530 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
P18530 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18530 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18530 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18530 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18530 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18530 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18530 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18530 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18530 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18530 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18530 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18530 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18530 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18530 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18530 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
P18530 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
P18530 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18530 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18530 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18530 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18530 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P18530 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18530 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18530 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18530 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18530 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18530 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18530 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18530 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18530 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18530 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18530 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18530 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18530 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18530 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18530 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18530 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18530 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18530 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18530 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18530 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18530 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18530 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18530 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18530 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
P18530 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P18530 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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