Protein–RNA interactions for Protein: O54946

Dnajb6, DnaJ homolog subfamily B member 6, mousemouse

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Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb6O54946 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajb6O54946 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Dnajb6O54946 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnajb6O54946 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms