Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SGSM2O43147 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SGSM2O43147 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SGSM2O43147 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SGSM2O43147 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SGSM2O43147 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SGSM2O43147 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SGSM2O43147 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SGSM2O43147 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SGSM2O43147 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SGSM2O43147 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms