Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cited2O35740 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cited2O35740 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cited2O35740 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cited2O35740 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cited2O35740 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cited2O35740 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cited2O35740 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cited2O35740 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cited2O35740 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Cited2O35740 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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