Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.75
Gm21900J3QP38 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
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Gm21900J3QP38 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
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Gm21900J3QP38 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm21900J3QP38 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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