Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vmn1r34G3XA52 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms