Protein–RNA interactions for Protein: E9PWW9

Rsf1, Remodeling and spacing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsf1E9PWW9 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rsf1E9PWW9 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms