Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rrn3B2RS91 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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