Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

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Length 401 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Gm5538W4VSP6 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5538W4VSP6 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5538W4VSP6 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
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