Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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Lgr5Q9Z1P4 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lgr5Q9Z1P4 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Lgr5Q9Z1P4 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Lgr5Q9Z1P4 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Lgr5Q9Z1P4 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Lgr5Q9Z1P4 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Lgr5Q9Z1P4 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Lgr5Q9Z1P4 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Lgr5Q9Z1P4 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lgr5Q9Z1P4 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms