Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFT172Q9UG01 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT172Q9UG01 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms