Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ripk3Q9QZL0 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ripk3Q9QZL0 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms