Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
OtofQ9ESF1 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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