Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7A6

Srp19, Signal recognition particle 19 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp19Q9D7A6 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Srp19Q9D7A6 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms